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DBSNP数据库是NCBI维护的一个大型数据库,包含人类基因组中的遗传变异信息,特别是单核苷酸多态性(SNP)和短插入/缺失(indels)。 下面介绍一下DBSNP数据库的特色:
特色
- 内容全面采集:DBSNP 该数据库包括SNP和短插入/缺失多态性等数据,以及微卫星标记和短重复序列。
- 数据丰富:DBSNP 数据库收集了超过 1.84 亿份提交内容,代表了我所做的 55 个物种的超过 6400 万种不同变体。
- 支持多种查询方式:用户可以通过RS编号、SS编号等方式查询,获取特定SNP的详细信息。
- 数据更新和维护:DBSNP数据库进行更新,包含最新的遗传变异数据,以确保数据的准确性和完整性。
- 数据下载和访问:DBSNP数据库有多种格式,包括FASTA格式的序列数据,方便用户进一步分析。
数据库结构
DBSNP 数据库遵循“中心辐射”模型。 核心是 dbSNPmain,它包含主表,辐条是包含特定生物体数据的子数据库。
查询示例
这里是检索NAT5中各种SNP的基因序列的示例。 用户可以从NCBI主页访问DBSNP并输入RS编号来查询特定SNP的序列。 突变类型、碱基变化、群体频率等详细信息。
DBSNP数据库通过全面的数据采集、丰富的查询方式以及持续的数据更新和维护,为遗传学研究人员提供了一个强大的数据库。 方便的数据下载和访问功能。 帮助您更好地理解和分析遗传变异的工具。
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